Vào ngày 12 tháng 6 năm 2000, Tổng thống Sierra Leone Ahmad Tejan Kabbah đã viết một lá thư gửi Tổng thư ký Liên Hợp Quốc Kofi Annan yêu cầu cộng đồng quốc tế thử những người chịu trách nhiệm về tội ác trong cuộc xung đột.[5] Vào ngày 10 tháng 8 năm 2000, Hội đồng Bảo an Liên Hợp Quốc đã thông qua Nghị quyết 1315 yêu cầu Tổng thư ký bắt đầu đàm phán với chính phủ Sierra Leone để tạo ra một Tòa án đặc biệt.

Vào ngày 16 tháng 1 năm 2002, Liên Hợp Quốc và chính phủ Sierra Leone đã ký một thỏa thuận thành lập tòa án. Một hợp đồng đã được trao cho Sierra Construction Systems, công ty xây dựng lớn nhất ở Sierra Leone, để xây dựng tòa nhà sẽ xây dựng tòa án. Các nhân viên đầu tiên đã đến Freetown vào tháng 7/2002. [cần dẫn nguồn]

Vào ngày 10 tháng 3 năm 2004, tòa nhà tòa án mới của Tòa án đặc biệt cho Sierra Leone đã chính thức được khai trương, trước một khán giả gồm các chức sắc trong nước và quốc tế.

Tính đến tháng 4 năm 2012, hơn 40 quốc gia đã đóng góp quỹ cho công việc của tòa án, trong đó người đóng góp đáng chú ý nhất ở châu Phi là Nigeria. Trong năm 2004, 2011 và 2012, SCSL đã nhận được tài trợ từ các khoản trợ cấp từ Liên Hợp Quốc.[6]